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* Facteurs endogènes : il existe également des facteurs [[génétique]]s à cette maladie. Il existe ainsi une concordance chez les vrais [[jumeaux]] près de quatre fois supérieure que chez les faux jumeaux<ref>Sullivan KE, [http://www.rheumatic.theclinics.com/article/S0889-857X(05)70137-X/abstract ''Genetics of systemic lupus erythematosus: clinical implications''], Rheum Dis Clin North Am, 2000;26:229-256</ref>. De même, certains groupes [[Human leukocyte antigen|HLA]] sont plus fréquemment retrouvés<ref name="nejm2008"/>. La présence d'une mutation sur un certain nombre de gènes semblent contribuer à l'apparition de la maladie. Ainsi des mutations sur les gènes ''IRF5, ITGAM, STAT4, BLK, BANK1, PDCD1, PTPN22, TNFSF4, TNFAIP3, SPP1'',<ref>Moser KL, Kelly JA, Lessard CJ, Harley JB, [http://www.nature.com/gene/journal/v10/n5/full/gene200939a.html ''Recent insights into the genetic basis of systemic lupus erythematosus''], Genes Immun, 2009;10:373-379</ref>, ''TNIP1, PRDM1, JAZF1, UHRF1BP1'' et ''IL10''<ref>Gateva V, Sandling JK, Hom G et al. [http://www.nature.com/ng/journal/v41/n11/full/ng.468.html ''A large-scale replication study identifies TNIP1, PRDM1, JAZF1, UHRF1BP1 and IL10 as risk loci for systemic lupus erythematosus''], Nat Genet, 2009;41:1228-1233</ref> ainsi que des déficit en plusieurs facteurs du [[système du compléments]] (C1q, C4 et C2) ont été identifiées. L'atteinte de certains de ces gènes ont été liées à d'autres maladies et il est probable que l'apparition d'un lupus nécessite l'atteinte de plusieurs gènes en plus d'un facteur exogène<ref>Tsokos G, [http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMra1100359 ''Systemic lupus erythematosus''], N Engl J Med, 2011;365:2110-2121</ref>.