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<br />Ainsi méningoradiculites douloureuses, encéphalites et encéphalomyélites constituent un tableau clinique fréquent, avec d'éventuelles manifestations dépressives et une fatigue chronique durant les phases de crises. Le diagnostic ne peut alors être confirmé que par l'association d'arguments cliniques, épidémiologiques et biologiques (à ce stade, l'infection active est habituellement détectable dans le liquide céphalorachidien et sur les tests bactériologiques sanguins pertinents, mieux qu'en phase 3).
 
==== Neuroborréliose ====
'''La neuroborréliose :''' ElleCelle-ci se traduit souvent d'abord par des [[méningo-radiculite]]s, dont les symptômes sont des douleurs [[racine nerveuse|radiculaires]] avec inflammation d'un ou plusieurs nerfs crâniens, pouvant se traduire par paralysie faciale périphérique (uni ou bilatérale, de type [[paralysie de Bell]] définie par une perte de tonus musculaire d'un ou des deux côtés du visage, simulant une paralysie faciale ''a frigore'')) ou par une [[méningite lymphocytaire]] d'évolution prolongée et parfois par une [[méningo-myélite]] ou une méningo-encéphalite, mais il existe de nombreux cas atypiques (ex :rachialgie inflammatoire sans radiculite<ref> Séverine Chanier, Michel Lauxerois et Virginie Rieu ; ''Rachialgies sans radiculite révélant une maladie de Lyme: À propos de deux cas'' ( Back pain without radiculitis as an initial manifestation of Lyme disease; Two cases) ; La Presse Médicale ; Volume 36, Issue 1, Part 1, January 2007, Pages 61-63 </ref> ou neuropathie sensitive subaiguë <ref>E. Thouvenot, K. Hadjout, S. Grosleron, J.M. Blard et M. Pagès, ''Neuropathie sensitive ataxiante et maladie de Lyme'' (Ataxic sensory neuropathy and Lyme disease) ; Revue Neurologique Volume 160, Issues 8-9, September 2004, Pages 833-835 ; DOI:10.1016/S0035-3787(04)71040-1</ref>). La méningite est parfois cliniquement muette, souvent caractérisée par des maux de tête, une raideur de la nuque, et parfois par une sensibilité à la lumière. Dans tous ces cas, une [[ponction lombaire]] permet de confirmer une méningite lymphocytaire. En cas de paralysie faciale périphérique, une [[sérologie]] positive est considérée comme suffisante pour confirmer le diagnostic et prescrire une antibiothérapie (grade C).
<br />Des problèmes neurologiques aigus apparaissent chez 15 % des patients non traités, pouvant inclure un large spectre de troubles<ref>Auwaerter PG, Aucott J, Dumler JS (January 2004). ''[http://journals.cambridge.org/action/displayAbstract?fromPage=online&aid=202506 Lyme borreliosis (Lyme disease): molecular and cellular pathobiology and prospects for prevention, diagnosis and treatment].'' Expert Rev Mol Med 6 (2): 1–22. ; DOI:10.1017/S1462399404007276 ; PMID:14987414</ref>. La méningite ou un [[syndrome de Guillain-Barré]] peuvent apparaître, avec des douleurs interférant avec le [[sommeil]], et des sensations anormales de la peau.<br />
Les atteintes radiculaires sont surtout sensitives. Les radiculites hyperalgiques résistent aux antalgiques habituels et aux anti-inflammatoires non-stéroïdiens (attention les stéroïdes sont soupçonnés de pouvoir aussi réveiller une arthrite de Lyme). Les douleurs sont souvent violentes et parfois associées à des [[paresthésie]]s. Les atteintes motrices périphériques (de type paralysies asymétriques) régressent en général (provisoirement) après six à huit semaines
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<br />Une légère encéphalite peut conduire des troubles du sommeil, de la mémoire et/ou de l'humeur (un état mental altéré a déjà été signalé comme simple et seul symptôme chez des patients en début de neuroborréliose<ref>Chabria SB, Lawrason J (2007). ''Altered mental status, an unusual manifestation of early disseminated Lyme disease: A case report''. Journal of Medical Case Reports 1 (1): 62.; DOI:10.1186/1752-1947-1-62 : PMID:17688693</ref>).
 
==== Arthrite de Lyme ====
L''''arthriteCette de Lyme''', elledernière survient au moins deux mois, à plusieurs années après l'inoculation et pour des raisons encore mal comprises touche généralement surtout et/ou d'abord le [[genou]] (suivi de l'épaule et du coude, statistiquement parlant).
 
==== Autres symptômes ====
Ces symptômes neurologiques et articulaires peuvent être accompagnés d'une fatigue chronique.
Des palpitations cardiaques (trouble de conduction bénin) peuvent se produire et (plus rarement) une insuffisance cardiaque.